Des échantillons ont été prélevés sur neuf sites répartis dans la région d'étude en 2008 et 2009. Pour éviter toute confusion liée aux saisons, les mêmes sites ont été échantillonnés au cours de la même saison chaque année. L'échantillonnage a été effectué à bord du NGCC Amundsen entre juillet et octobre dans le cadre de l'étude circumpolaire Flaw Lead, des expéditions ArcticNet en collaboration avec le Canadian Healthy Ocean Network et le projet Malina. Les sites ont été choisis pour étudier à la fois les points chauds et les points froids de l'Arctique canadien.
À chaque station d'échantillonnage, un carottier USNEL a été déployé pour la collecte des sédiments du fond marin. Trois à cinq sous-carottes de 10 cm de diamètre et d'une profondeur de sédiment d'environ 20 cm ont été prélevées dans chaque boîte afin d'évaluer la fonction de reminéralisation benthique dans les incubations de microcosmes à bord des navires. Après incubation, les mêmes carottes de sédiments ont été passées à travers un tamis à mailles de 0,5 mm sous de l'eau de mer à courant lent. Les résidus du tamis ont été conservés dans un contenant de 4 %
solution d'eau de mer et de formaldéhyde pour des analyses ultérieures de la diversité et de l'abondance des espèces au microscope à dissection.
