Dans le cadre du NCP et d'ArcticNet, des échantillons d'air, d'eau, de sédiments et de zooplancton ont été prélevés à bord du NGCC Amundsen. Des échantillons d'eau supplémentaires ont été prélevés auprès du NGCC Laurier dans la mer de Beaufort. Différents types d'échantillons d'eau ont été prélevés : échantillons instantanés et échantillons passifs. Des échantillons gradués d'eau de surface (1 L) et d'eau en profondeur ont été prélevés dans des bouteilles en verre pour les produits ignifuges et renvoyés au laboratoire pour y être traités. Des échantillons choisis de composés perfluorés (1 L) ont également été prélevés à la surface et à deux ou trois profondeurs dans des bouteilles en plastique, puis renvoyés au laboratoire pour y être traités. Des échantillons d'eau ponctuels (100 L) ont également été prélevés pour détecter la présence de pesticides anciens et actuels et de produits chimiques associés au plastique. Des échantillons d'eau passifs ont été placés sur des mouillages dans la mer de Beaufort et dans la baie de Baffin. Ces échantillons restent dans la colonne d'eau pendant un an, après quoi ils sont récupérés et renvoyés au laboratoire pour analyse. Des échantillons d'air sont prélevés à la proue du CCGS Amundsen. Il s'agit d'échantillons continus utilisés pour surveiller les pesticides existants et actuels, les ignifugeants, les composés perfluorés et polyfluorés et les produits chimiques associés au plastique. Les sédiments sont prélevés à l'aide d'un carottier, la surface de 0 à 5 cm est grattée, placée dans un bocal en verre et renvoyée au laboratoire pour analyse pour les mêmes produits chimiques énumérés ci-dessus. Les échantillons de zooplancton sont prélevés à l'aide de chaluts d'une taille nette de 200 um. Le zooplancton en vrac est classé par espèce et analysé en fonction de la liste de produits chimiques ci-dessus. À leur retour au laboratoire, les échantillons sont extraits, traités et analysés par spectrométrie de masse par chromatographie en phase gazeuse et/ou par chromatographie liquide-spectrométrie de masse.